Synoniemen
Matrix extra
invasieve S. pyogenes, S. dysgalactiae, S. equi of S. canis stammen
Afnamerecipiënt Extra
Monsterverzending extramuros
Kamertemperatuur
Uitvoerende afdeling
Uitvoerfrequentie
Uitvoer Frequentie Extra
Beproevingsmethode
Extractie DNA uit matrix met NucliSens easyMAG toestel (BioMérieux), amplificatie DNA via conventionele singleplex PCR, Sanger sequencing van het amplicon (uitbesteed aan VIB), bepaling emm-type via indienen sequentie bij CDC-databank (https://www2a.cdc.gov/ncidod/biotech/strepblast.asp). (ISO 15189 204-MED accreditatie enkel voor deze analyse, niet voor WGS)
OF
Manuele DNA extractie door middel QIAsymphony DSP virus/pathogen midi kit (Qiagen), aanmaken en aanrijken van library via Nextera XT, sequencing met MiSeq (Illumina), data analyse via 1928 software of BacPipe en ParSNP (indien ook aanvraag voor virulentie- of antibioticaresistentie genen)
Accreditering
Aanrekening onder RIZIV
Neen, test wordt aangerekend via de referentie-activiteiten
Aanrekening patiënt
Neen
Opmerking
Deze test wordt uitgevoerd in het kader van de activiteiten van het NRC invasieve β-hemolytische streptokokken niet behorend tot Groep B: Nationaal Referentiecentrum (NRC) voor Streptococcus pyogenes en andere invasieve Β-hemolytische streptokokken niet behorend tot groep B | sciensano.be.