Synoniemen

invasieve GAS, GCS en GGS

Matrix extra

invasieve S. pyogenes, S. dysgalactiae, S. equi of S. canis stammen

Afnamerecipiënt Extra

Reinkweek op plaat met afzonderlijke kolonies

Monsterverzending extramuros

​Kamertemperatuur

Uitvoerende afdeling

Moleculaire Diagnostiek

Uitvoerfrequentie

maandelijks

Uitvoer Frequentie Extra

TAT = 35 dagen

Beproevingsmethode

​Extractie DNA uit matrix met NucliSens easyMAG toestel (BioMérieux), amplificatie DNA via conventionele singleplex PCR, Sanger sequencing van het amplicon (uitbesteed aan VIB), bepaling emm-type via indienen sequentie bij CDC-databank (https://www2a.cdc.gov/ncidod/biotech/strepblast.asp). (ISO 15189 204-MED accreditatie enkel voor deze analyse, niet voor WGS)

OF

Manuele DNA extractie door middel QIAsymphony DSP virus/pathogen midi kit (Qiagen), aanmaken en aanrijken van library via Nextera XT, sequencing met MiSeq (Illumina), data analyse via 1928 software of BacPipe en ParSNP​ (indien ook aanvraag voor virulentie- of antibioticaresistentie genen)

 

Accreditering

ISO 15189 204-MED

Aanrekening onder RIZIV

Neen, test wordt aangerekend via de referentie-activiteiten

Aanrekening patiënt

Neen

Opmerking

​Deze test wordt uitgevoerd in het kader van de activiteiten van het NRC invasieve β-hemolytische streptokokken niet behorend tot Groep B: Nationaal Referentiecentrum (NRC) voor Streptococcus pyogenes en andere invasieve Β-hemolytische streptokokken niet behorend tot groep B | sciensano.be.

Verantwoordelijke

Veerle Matheeussen